"Ora mi chiedo ma com'è che alcune cose, tipo il presepe, seppur scritte nei vangeli apocrifi"
Il presepe non sta nei Vangeli apocrifi, è una semplice rtappresentazione della nascita di Cristo con
alcuni elementi dai vangeli apocrifi, come il bue e l'asinello.
"(anche il fatto che Gesù sia nato in una grotta"
Questo non è confermabile biblicamente ma archeologicamente. A Betlemme a quel tempo le stalle, e le stesse case, non erano altro che ripari fabbricati partendo da piccole rientranze nel terreno, cioè grotte.
"e i nomi dei tre Re magi) la Chiesa li accetta ma altre no? in base a quale criterio?"
La Chiesa non accetta alcunché, non c'è nessun documento del magistero intitolato: "Come fare il presepe", si tratta di semplici tradizioni popolari.
Ad maiora
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Ά όταν έκτιζαν τα τείχη πώς να μην προσέξω.
Αλλά δεν άκουσα ποτέ κρότον κτιστών ή ήχον.
Ανεπαισθήτως μ' έκλεισαν απο τον κόσμο έξω
(Κ. Καβάφης)